SMA Negeri 2 Bondowoso memiliki sebuah lambing yang terurai dan punya arti sebagai berikut:
- Dasar lambang “Kuning Emas” yang dmaksudkan lambing kejayaan, kemurnian dan keluhuran serta kecemerlangan
- Guratan pelangi dengan warna”Merah” merupakan arti kebaktian kepada Tuhan Pencipta Alam Semesta.
- Bendera “Merah Putih” berbentuk lengkung berarti harus selalu berjiwa Patriot Bangsa Sejati, berdasarkakn Pancasila dan UUD 1945.
- Angka “2” menunjukkan identitas sekolah SMA Negeri 2
- Buku dengan mata pena warna “Putih” bergaris “Hitam” melambangkann pendidikan, pengetahuan ilmiah, Tutwuri Handayani.
- Bunga teratai “putih dan bersih”, dilukiskan dalam arti kesucian , kejujuran dan budi pekerti sebagai kekuatan dan sendi kehidupan bangsa Indonesia
- Daun teratai warna “Hijau Tua”, mempunyai arti sumber kekuatan dan kesejukan serta perlindungan dan kehidupan sebagai pengertian lambang diatasnya.
- Garis pelindung pokok simbul dengan garis tebal dan kecil warna “Hitam” dengan lima sudut menunjukkan pengertian bahwa kita bersendikan Pancasila sebagai Falsafah Hidup Bangsa